Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 E230020D15Rik-201ENSMUST00000208097 5899 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm20518-201ENSMUST00000150068 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm37673-201ENSMUST00000194880 2451 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Ccser2-207ENSMUST00000182797 1482 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Tmem209-203ENSMUST00000115157 2273 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Cul2-201ENSMUST00000025073 3727 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Cenpi-202ENSMUST00000101251 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm38236-201ENSMUST00000192661 3229 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Lyn-202ENSMUST00000103010 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Zfp248-201ENSMUST00000069292 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Rerg-201ENSMUST00000032347 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Ighv1-59-201ENSMUST00000103530 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm12170-201ENSMUST00000119281 300 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm14648-201ENSMUST00000119328 483 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Rpl21-ps15-201ENSMUST00000121545 483 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Snhg17-202ENSMUST00000138592 342 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Dcpp2-202ENSMUST00000168272 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ube3bQ9ES34 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Ms4a10-203ENSMUST00000191343 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 AC160338.2-201ENSMUST00000215508 281 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm29807-201ENSMUST00000220161 372 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 AC123867.1-201ENSMUST00000224990 816 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Hist1h1t-201ENSMUST00000041052 912 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 1700028K03Rik-201ENSMUST00000058921 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Tarm1-201ENSMUST00000065703 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Klk1b11-201ENSMUST00000007156 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Ms4a10-201ENSMUST00000072748 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Ube2e2-201ENSMUST00000076133 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Rpl21-ps7-201ENSMUST00000077420 483 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 H2al1j-201ENSMUST00000091180 330 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 AC121942.3-201ENSMUST00000225768 1436 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm37314-201ENSMUST00000193545 2685 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Fam110b-202ENSMUST00000108380 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Eif4enif1-201ENSMUST00000020734 3565 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Olfr152-203ENSMUST00000215394 2172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ube3bQ9ES34 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Arhgef9-210ENSMUST00000182001 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm44610-201ENSMUST00000209012 3827 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm12253-201ENSMUST00000108825 1356 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ube3bQ9ES34 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ube3bQ9ES34 Prom1-214ENSMUST00000197706 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Elp3-201ENSMUST00000022609 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Flrt3-201ENSMUST00000056760 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Tbc1d24-208ENSMUST00000201089 4081 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 2610037D02Rik-202ENSMUST00000185067 2997 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 G430049J08Rik-201ENSMUST00000179907 2686 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 AC132392.1-202ENSMUST00000216652 2681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm35608-201ENSMUST00000218472 2370 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Trpv2-201ENSMUST00000018651 2909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Sdr42e1-202ENSMUST00000173522 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Sgpl1-201ENSMUST00000092498 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm5442-201ENSMUST00000202121 2034 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Tbc1d24-207ENSMUST00000171189 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Lhx6-202ENSMUST00000112961 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Cd68-202ENSMUST00000108654 1008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm5915-201ENSMUST00000116136 454 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm13879-201ENSMUST00000118308 242 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm13500-201ENSMUST00000119348 824 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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