Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm11901-201ENSMUST00000120412 437 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm3534-201ENSMUST00000182522 1001 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm29238-201ENSMUST00000189709 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Cdc6-201ENSMUST00000092706 4614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Rnf38-201ENSMUST00000045793 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Zmynd8-204ENSMUST00000109262 2515 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Ciart-201ENSMUST00000036418 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Akr1b10-201ENSMUST00000038383 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Tdpoz1-202ENSMUST00000181541 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm20852-201ENSMUST00000178761 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Zfp87-203ENSMUST00000181573 382 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm9322-201ENSMUST00000188144 958 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riok3Q9DBU3 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms