Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm43568-202ENSMUST00000198427 476 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Olfr32-206ENSMUST00000215765 1241 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 B230364G03Rik-201ENSMUST00000181479 1374 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Pxmp4-201ENSMUST00000000896 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Adgrl2-204ENSMUST00000195988 4541 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ptges-202ENSMUST00000102852 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ebpl-201ENSMUST00000022494 10092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Dgkg-202ENSMUST00000089925 3555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Tnfaip1-202ENSMUST00000108277 3768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm12394-201ENSMUST00000107981 3348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Olfr523-203ENSMUST00000213953 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Igkv3-4-201ENSMUST00000103401 360 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Selenok-ps7-201ENSMUST00000197069 283 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm42897-201ENSMUST00000201486 2112 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Dusp3-201ENSMUST00000003612 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Vmn2r8-201ENSMUST00000172140 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Cd247-208ENSMUST00000178336 2807 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Synpo2-201ENSMUST00000051443 3719 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Aplnr-201ENSMUST00000057019 3699 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Hnmt-203ENSMUST00000114498 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Zfp939-201ENSMUST00000061201 2131 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Tdrd1-204ENSMUST00000121249 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms