Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Zbtb34-202ENSMUST00000113158 6602 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm45768-201ENSMUST00000206763 3202 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Klhl41-201ENSMUST00000100050 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 2310069B03Rik-202ENSMUST00000186147 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm12848-201ENSMUST00000119777 842 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm44764-202ENSMUST00000204912 671 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm31784-201ENSMUST00000209523 1053 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Tigar-201ENSMUST00000039913 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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