Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm29471-201ENSMUST00000190527 700 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm8010-201ENSMUST00000194128 873 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm44156-201ENSMUST00000203885 1189 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Klk1b14-ps-201ENSMUST00000206059 777 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm7482-201ENSMUST00000206446 505 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm44588-201ENSMUST00000208401 545 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm3774-201ENSMUST00000209773 435 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm5609-201ENSMUST00000210008 1267 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm7850-201ENSMUST00000212909 712 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 2900045O20Rik-201ENSMUST00000218374 1292 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 AC132468.1-201ENSMUST00000224706 499 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Rasgrf1-201ENSMUST00000034909 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Thyn1-201ENSMUST00000039161 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Glrx-204ENSMUST00000223120 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Rps19-ps2-201ENSMUST00000100614 438 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Zfx-202ENSMUST00000113925 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm24063-201ENSMUST00000157491 105 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Rps19-ps1-201ENSMUST00000168472 438 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm8696-201ENSMUST00000174777 385 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm42667-201ENSMUST00000196132 234 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm44725-201ENSMUST00000205307 391 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm44721-201ENSMUST00000206978 472 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 AC119987.1-201ENSMUST00000212316 848 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 AL645704.1-201ENSMUST00000221642 604 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 AC142114.1-201ENSMUST00000227724 328 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm21957-201ENSMUST00000073056 438 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm44752-201ENSMUST00000207140 3305 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm28791-201ENSMUST00000185888 1779 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Tex24-201ENSMUST00000095375 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Olfr212-202ENSMUST00000218028 2291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxc5P32043 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Lppos-201ENSMUST00000181640 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm30382-202ENSMUST00000199007 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Lrcol1-201ENSMUST00000100924 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Efcab9-202ENSMUST00000109377 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Amd-ps4-201ENSMUST00000118392 1003 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms