Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm40040-201ENSMUST00000196123 504 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm17979-201ENSMUST00000196646 611 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm43568-202ENSMUST00000198427 476 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm34418-201ENSMUST00000212879 309 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 AC122533.2-201ENSMUST00000223772 545 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Olfr901-201ENSMUST00000063716 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Mir185-201ENSMUST00000083530 65 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm16434-201ENSMUST00000100888 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm6676-201ENSMUST00000166493 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gpnmb-201ENSMUST00000031840 3701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Tmem164-203ENSMUST00000112888 4221 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Zfp871-202ENSMUST00000159086 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Olfr1221-204ENSMUST00000217635 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm3269-201ENSMUST00000166025 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Serping1-201ENSMUST00000023994 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm13651-201ENSMUST00000119086 1110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm14186-201ENSMUST00000120804 137 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm36849-201ENSMUST00000210345 680 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm5535-208ENSMUST00000210482 1403 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Lrrc1-201ENSMUST00000113421 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Zscan22-202ENSMUST00000117189 2995 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Vezt-203ENSMUST00000118205 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Hipk1-203ENSMUST00000118317 7939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Tmem177-201ENSMUST00000037906 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm16316-201ENSMUST00000154065 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm13358-201ENSMUST00000121427 569 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Hrh1-205ENSMUST00000161650 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Speer9-ps1-201ENSMUST00000203447 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm18973-201ENSMUST00000205814 511 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Ulk4-201ENSMUST00000051479 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Drp2-204ENSMUST00000113228 3141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Adra1a-201ENSMUST00000054661 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm16050-201ENSMUST00000160626 2363 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Vrk1-203ENSMUST00000085026 3711 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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