Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Nbr1-207ENSMUST00000107218 3353 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 D630033O11Rik-205ENSMUST00000210802 2761 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 AC159379.2-201ENSMUST00000220244 2482 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Limch1-203ENSMUST00000117601 3157 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Nckap1l-201ENSMUST00000047405 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Lrrc18-201ENSMUST00000038956 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm12870-201ENSMUST00000121383 1016 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm13218-201ENSMUST00000128180 265 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Rab36-206ENSMUST00000146440 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Fundc1-205ENSMUST00000177213 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm43471-201ENSMUST00000197550 467 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm18631-201ENSMUST00000223125 1043 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 D5Ertd615e-202ENSMUST00000197016 3911 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Olfr654-203ENSMUST00000213984 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Ciao1-201ENSMUST00000003759 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Zfp819-201ENSMUST00000032661 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Hnf4g-201ENSMUST00000108393 2224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 St7-206ENSMUST00000115417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Atxn7l1-213ENSMUST00000154742 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Fmo5-202ENSMUST00000107049 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Pax9-201ENSMUST00000001538 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 AC131743.4-201ENSMUST00000221638 1553 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Smpd4-203ENSMUST00000090159 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Nxpe4-202ENSMUST00000215780 2875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 4930543E12Rik-202ENSMUST00000210408 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Siglech-202ENSMUST00000094360 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm2a-201ENSMUST00000000608 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm5654-201ENSMUST00000217787 475 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Idi2-201ENSMUST00000038598 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Ccnb1-202ENSMUST00000091295 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Rnf19a-203ENSMUST00000228358 3452 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm43776-201ENSMUST00000199729 2914 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Vezt-203ENSMUST00000118205 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 AC120163.1-201ENSMUST00000228618 1680 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Cacna1f-202ENSMUST00000115726 6079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 5330417C22Rik-201ENSMUST00000048012 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gbp8-201ENSMUST00000031235 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Prkrip1-204ENSMUST00000151786 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Slc12a3-201ENSMUST00000034218 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Prkcz-202ENSMUST00000103178 4083 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Olfr806-202ENSMUST00000213239 3724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 A930104D05Rik-201ENSMUST00000128601 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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