Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Tmem147-206ENSMUST00000208169 537 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Hapln3-203ENSMUST00000206092 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Ssr3-202ENSMUST00000119896 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Prmt7-201ENSMUST00000071592 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Lilr4b-201ENSMUST00000102894 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Cyp2c50-202ENSMUST00000080171 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm9458-201ENSMUST00000135273 727 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Trim35Q8C006 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Trim35Q8C006 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm45901-201ENSMUST00000203807 661 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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