Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Msra-204ENSMUST00000210363 1042 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 5830408C22Rik-204ENSMUST00000211653 351 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm18641-201ENSMUST00000211763 1246 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC167017.1-201ENSMUST00000214975 412 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC102000.1-201ENSMUST00000226247 727 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC133156.2-201ENSMUST00000226865 784 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Zfp473-201ENSMUST00000060270 3800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm10015-201ENSMUST00000072570 465 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 9430073C21Rik-201ENSMUST00000145346 2173 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm3286-201ENSMUST00000171752 1316 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Kif5a-202ENSMUST00000217895 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Slc25a14-202ENSMUST00000114936 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Tbc1d15-201ENSMUST00000020339 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Kng1-203ENSMUST00000089902 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm28229-201ENSMUST00000188747 2153 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC165260.6-205ENSMUST00000224190 9762 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Naa11-201ENSMUST00000060265 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Clca2-201ENSMUST00000040465 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Igkv2-112-202ENSMUST00000103319 358 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Snora17-201ENSMUST00000104004 132 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Anapc15-205ENSMUST00000106978 841 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm14532-201ENSMUST00000156115 279 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Mir1964-201ENSMUST00000158514 83 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Sdhd-201ENSMUST00000000175 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Rps10-208ENSMUST00000178774 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 2900076A07Rik-203ENSMUST00000180879 725 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm17828-201ENSMUST00000183380 799 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm27353-201ENSMUST00000184712 122 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 1700120C14Rik-201ENSMUST00000187706 326 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm7893-201ENSMUST00000189666 225 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Cdk2ap1-205ENSMUST00000196910 483 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC153569.1-201ENSMUST00000215873 807 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm5654-201ENSMUST00000217787 475 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC144461.2-201ENSMUST00000218219 303 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC112157.1-201ENSMUST00000226016 543 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC154640.1-204ENSMUST00000227105 648 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Fam166a-201ENSMUST00000028346 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Olfr214-201ENSMUST00000060204 1008 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Dppa5a-201ENSMUST00000071991 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Zdhhc22-201ENSMUST00000095521 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Txnip-202ENSMUST00000074519 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Asb17-201ENSMUST00000044089 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Tprkb-201ENSMUST00000067137 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Fignl1-201ENSMUST00000047689 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Hnmt-203ENSMUST00000114498 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Gm4863-201ENSMUST00000196907 1381 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Hrh2-201ENSMUST00000038101 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Ccser2-209ENSMUST00000183038 1681 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Skap2Q3UND0 Il1r2-201ENSMUST00000027243 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms