Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Arpp19-205ENSMUST00000168166 3944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Cep112-216ENSMUST00000182729 2850 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm9750-201ENSMUST00000142025 2017 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Nt5c1b-217ENSMUST00000219826 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm2447-202ENSMUST00000193813 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Kcnma1-206ENSMUST00000163322 3162 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Kcnma1-210ENSMUST00000179836 3177 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Zkscan1-204ENSMUST00000110963 4670 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Cse1l-201ENSMUST00000002790 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Tmem63c-202ENSMUST00000131878 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm27034-201ENSMUST00000182552 940 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Olfr312-201ENSMUST00000078217 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Vmn1r64-201ENSMUST00000078475 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm29311-202ENSMUST00000189721 1532 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Ift122-202ENSMUST00000112923 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Rars-201ENSMUST00000018992 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Olfr1510-202ENSMUST00000215928 1934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprkP35822 C7-201ENSMUST00000110689 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm37536-201ENSMUST00000194710 2491 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Lyn-202ENSMUST00000103010 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm8049-201ENSMUST00000214336 1782 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm43776-201ENSMUST00000199729 2914 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Hfe-202ENSMUST00000091706 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Egf-202ENSMUST00000197079 3346 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 5330417C22Rik-201ENSMUST00000048012 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Egflam-202ENSMUST00000096494 4391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Hmgcs1-202ENSMUST00000224188 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Rab36-206ENSMUST00000146440 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Slc7a2-202ENSMUST00000098816 3677 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprkP35822 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
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