Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 1700120C14Rik-201ENSMUST00000187706 326 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm37643-201ENSMUST00000195369 1260 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 AC140409.1-201ENSMUST00000213907 457 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm34278-201ENSMUST00000220534 622 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm28905-202ENSMUST00000219328 1377 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm12619-201ENSMUST00000117369 385 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm12180-201ENSMUST00000120905 661 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm12517-201ENSMUST00000122082 425 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm20508-201ENSMUST00000172480 487 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm15645-202ENSMUST00000183393 1299 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm28865-201ENSMUST00000187685 723 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm35106-201ENSMUST00000192731 250 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm40040-201ENSMUST00000196123 504 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Spa17-201ENSMUST00000002013 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm43903-201ENSMUST00000205126 617 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm34664-202ENSMUST00000207661 1032 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm45674-201ENSMUST00000210043 450 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 D330037F02Rik-202ENSMUST00000217400 1247 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm2721-202ENSMUST00000222652 459 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Krtap10-4-201ENSMUST00000092369 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Mrgprx1-201ENSMUST00000094390 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm11223-201ENSMUST00000120560 450 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm14514-201ENSMUST00000121680 940 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm5398-201ENSMUST00000121933 984 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Hk1os-203ENSMUST00000143122 1218 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 4833417C18Rik-201ENSMUST00000146868 1269 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 1700019N19Rik-202ENSMUST00000166692 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Fundc1-205ENSMUST00000177213 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm8254-201ENSMUST00000182326 972 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm26964-201ENSMUST00000182516 832 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 1700022H16Rik-201ENSMUST00000188935 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm29388-201ENSMUST00000190718 284 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Smim18J3QNP2 Gm42429-201ENSMUST00000198579 558 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms