Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Fam217a-201ENSMUST00000021851 2402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Kbtbd4-201ENSMUST00000090682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 B930095G15Rik-201ENSMUST00000130256 4715 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Aoah-201ENSMUST00000021757 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Washc2-201ENSMUST00000036759 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Zmym3-203ENSMUST00000117901 5178 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Hrh1-205ENSMUST00000161650 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Mkrn2-201ENSMUST00000000449 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Xntrpc-201ENSMUST00000084843 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm37549-201ENSMUST00000194096 4065 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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OtofQ9ESF1 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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OtofQ9ESF1 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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OtofQ9ESF1 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Arpp21-201ENSMUST00000035085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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OtofQ9ESF1 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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OtofQ9ESF1 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 D7Bwg0826e-201ENSMUST00000208484 3795 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Actr10-201ENSMUST00000021479 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Lhfpl2-202ENSMUST00000118195 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 F630040K05Rik-201ENSMUST00000180519 2841 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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OtofQ9ESF1 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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OtofQ9ESF1 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm4907-202ENSMUST00000163718 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Ambra1-201ENSMUST00000045699 4690 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Zfp90-205ENSMUST00000212874 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 1700123J17Rik-201ENSMUST00000206035 1805 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Rps20-203ENSMUST00000138502 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Zfp979-202ENSMUST00000105720 2594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Ano7-202ENSMUST00000186641 3984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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