Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Sept2-213ENSMUST00000168776 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Tacr3-201ENSMUST00000029822 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm37210-201ENSMUST00000192484 2004 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm3839-201ENSMUST00000181173 1712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Ndrg1-201ENSMUST00000005256 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm28447-202ENSMUST00000186677 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm27166-201ENSMUST00000184476 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gng7-202ENSMUST00000099462 3425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Sox6-203ENSMUST00000166207 2825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Nfam1-201ENSMUST00000023076 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm16008-201ENSMUST00000126009 810 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm13415-202ENSMUST00000135829 565 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Tle6-213ENSMUST00000151858 627 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm44641-201ENSMUST00000152342 323 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm20765-201ENSMUST00000177792 795 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm21312-201ENSMUST00000179258 795 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Fendrr-201ENSMUST00000181231 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 2310005E17Rik-201ENSMUST00000186644 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Spa17-201ENSMUST00000002013 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm6329-201ENSMUST00000209210 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 0610005C13Rik-211ENSMUST00000211530 402 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm4178-201ENSMUST00000218307 649 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 AC155644.1-201ENSMUST00000218527 890 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm9280-201ENSMUST00000223155 517 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Tctex1d1-208ENSMUST00000223169 683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 AC147044.1-201ENSMUST00000223850 552 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 AC110236.1-201ENSMUST00000227807 527 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Tssk4-206ENSMUST00000228041 1217 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Snora74a-201ENSMUST00000083715 196 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm15128-201ENSMUST00000112814 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Sytl4-201ENSMUST00000033608 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm28938-201ENSMUST00000187029 1495 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm29399-202ENSMUST00000187292 1495 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm29203-201ENSMUST00000187355 1495 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm29027-202ENSMUST00000187571 1495 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm28249-203ENSMUST00000190011 1495 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm30045-202ENSMUST00000193438 1495 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm32181-202ENSMUST00000194268 1495 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm36345-202ENSMUST00000194949 1495 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm31422-203ENSMUST00000195198 1495 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Gm30705-203ENSMUST00000195660 1495 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube3bQ9ES34 Pramef6-201ENSMUST00000081645 1487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ube3bQ9ES34 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Olfr117-203ENSMUST00000215414 3498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Zfp84-201ENSMUST00000032802 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Cntrob-201ENSMUST00000092973 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm43414-201ENSMUST00000197710 3188 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Wdr59-203ENSMUST00000211981 3618 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Xpo7-206ENSMUST00000228346 4491 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Clcn3-205ENSMUST00000110302 3768 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Efcab3-201ENSMUST00000021029 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm10286-201ENSMUST00000093603 5077 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gpr152-201ENSMUST00000096338 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Zmynd8-201ENSMUST00000018050 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 AC154634.1-201ENSMUST00000225225 2394 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Crebbp-205ENSMUST00000205765 7749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm23192-201ENSMUST00000102434 96 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Igkv12-89-201ENSMUST00000103335 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Arhgef10l-205ENSMUST00000105798 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm15220-201ENSMUST00000120730 379 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Cyp4a30-ps-201ENSMUST00000120813 1020 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm40614-201ENSMUST00000125161 1254 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms