Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Ttc41-205ENSMUST00000219108 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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PtprtQ99M80 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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PtprtQ99M80 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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PtprtQ99M80 Timeless-203ENSMUST00000105242 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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PtprtQ99M80 Atxn7l1-213ENSMUST00000154742 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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PtprtQ99M80 Lrrc8d-202ENSMUST00000120847 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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PtprtQ99M80 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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PtprtQ99M80 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Mas1-201ENSMUST00000089015 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Txnip-202ENSMUST00000074519 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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PtprtQ99M80 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PtprtQ99M80 Fundc1-205ENSMUST00000177213 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PtprtQ99M80 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Olfr1331-201ENSMUST00000094831 954 ntAPPRIS P2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Hnrnpk-205ENSMUST00000176207 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm40309-201ENSMUST00000202699 1752 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm45790-201ENSMUST00000211986 1629 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Nxpe4-202ENSMUST00000215780 2875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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