Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Nod2-202ENSMUST00000109634 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Gm37066-201ENSMUST00000192713 2061 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Pygl-202ENSMUST00000161083 2992 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Usp47Q8BY87 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Usp47Q8BY87 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Olfr1312-202ENSMUST00000213582 2891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Slc2a3-201ENSMUST00000032476 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp47Q8BY87 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Med12-202ENSMUST00000087956 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp47Q8BY87 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp47Q8BY87 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Ctns-202ENSMUST00000108476 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Ebpl-201ENSMUST00000022494 10092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Mroh2a-201ENSMUST00000061013 7526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Olfr557-202ENSMUST00000215423 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Baz2a-202ENSMUST00000170054 8372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Baz2a-201ENSMUST00000045621 8369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp47Q8BY87 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms