Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm44767-201ENSMUST00000206634 469 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm18820-201ENSMUST00000217424 916 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr1419-201ENSMUST00000087857 1160 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 n-R5s33-201ENSMUST00000093713 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Grxcr2-201ENSMUST00000097591 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Pcsk2-201ENSMUST00000028905 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Ctnna3-201ENSMUST00000075099 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Eda2r-202ENSMUST00000113832 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Ccr6-201ENSMUST00000097418 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Clec4f-201ENSMUST00000014686 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Pfkfb2-210ENSMUST00000189167 1558 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 BC039771-202ENSMUST00000144661 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Hrh1-203ENSMUST00000160780 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Tert-201ENSMUST00000022104 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gdi2-201ENSMUST00000059515 2077 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Sag-201ENSMUST00000077772 1719 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 CT010486.2-201ENSMUST00000224003 2714 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Apol7a-204ENSMUST00000176074 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Ccdc116-201ENSMUST00000023452 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Slc2a5-201ENSMUST00000030826 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Dgkg-202ENSMUST00000089925 3555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Mospd1-202ENSMUST00000096447 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Ms4a3-201ENSMUST00000112984 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Gm11520-201ENSMUST00000122837 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Myl12a-202ENSMUST00000123686 804 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Snhg17-208ENSMUST00000154242 346 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 1810021B22Rik-205ENSMUST00000162579 544 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm8425-201ENSMUST00000171395 769 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm25687-201ENSMUST00000175442 241 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm5435-201ENSMUST00000179295 1150 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm16470-201ENSMUST00000182456 998 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm28922-201ENSMUST00000189785 308 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm15860-203ENSMUST00000197262 360 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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