Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Pax3-202ENSMUST00000087086 3863 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Pcdh9-201ENSMUST00000068992 3714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm40309-201ENSMUST00000202699 1752 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Prnd-204ENSMUST00000110172 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Kcnma1-206ENSMUST00000163322 3162 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Kcnma1-210ENSMUST00000179836 3177 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Aebp1-201ENSMUST00000102923 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm17359-203ENSMUST00000199658 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Dhx30-202ENSMUST00000111991 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Lrrc9-203ENSMUST00000161284 3817 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Ambn-201ENSMUST00000031226 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Harbi1-205ENSMUST00000142692 3686 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC131743.4-201ENSMUST00000221638 1553 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Mas1-201ENSMUST00000089015 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Zfp607b-201ENSMUST00000076421 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gpbp1-202ENSMUST00000091236 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 4930438E09Rik-201ENSMUST00000176841 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm38051-201ENSMUST00000193740 433 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 1700018P08Rik-201ENSMUST00000212522 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 4930542C16Rik-201ENSMUST00000062438 1090 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Hk1-203ENSMUST00000116238 3851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Tead1-206ENSMUST00000164363 1495 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Zfp961-201ENSMUST00000109997 2713 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Rfxank-201ENSMUST00000075724 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Atr-201ENSMUST00000034980 8056 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Ripor2-203ENSMUST00000091694 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Ezh1-202ENSMUST00000107284 4207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 B020014A21Rik-201ENSMUST00000217333 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gbp8-201ENSMUST00000031235 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Zfp207-208ENSMUST00000188489 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 4930543E12Rik-202ENSMUST00000210408 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Tnfaip8-213ENSMUST00000180305 369 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Stx8-203ENSMUST00000108675 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm28670-201ENSMUST00000185365 1498 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm29537-202ENSMUST00000186153 1498 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm29497-201ENSMUST00000186801 1498 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm28568-201ENSMUST00000187762 1498 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm29445-202ENSMUST00000189947 1497 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm28458-202ENSMUST00000190542 1497 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm28457-202ENSMUST00000191277 1498 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm37654-201ENSMUST00000193019 1498 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Olfr608-201ENSMUST00000213546 1482 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Fgg-201ENSMUST00000048486 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm36799-201ENSMUST00000214113 1737 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 D130007C19Rik-201ENSMUST00000067277 1505 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Zkscan1-203ENSMUST00000110962 4843 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms