Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Lrrc1-201ENSMUST00000113421 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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PtprtQ99M80 Fam90a1a-201ENSMUST00000110741 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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PtprtQ99M80 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Dubr-205ENSMUST00000191079 2105 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Tcf23-201ENSMUST00000006818 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gata4-203ENSMUST00000121312 2407 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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