Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Mapk14-203ENSMUST00000114752 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Ptges-202ENSMUST00000102852 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Inpp1-201ENSMUST00000027271 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Slc1a7-201ENSMUST00000106713 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Topaz1-201ENSMUST00000178679 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gng7-204ENSMUST00000118233 3433 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 C330007P06Rik-202ENSMUST00000115248 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Olfr32-206ENSMUST00000215765 1241 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Pes1-202ENSMUST00000109985 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Pes1-201ENSMUST00000020705 2911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Vrk1-203ENSMUST00000085026 3711 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Zfp551-201ENSMUST00000080348 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Lmx1a-201ENSMUST00000028003 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Naa11-201ENSMUST00000060265 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Nbr1-207ENSMUST00000107218 3353 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Pgbd1-205ENSMUST00000151743 2642 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Apod-203ENSMUST00000130560 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm37069-201ENSMUST00000192742 4142 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Ambra1-201ENSMUST00000045699 4690 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Ano7-202ENSMUST00000186641 3984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms