Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm45323-201ENSMUST00000209853 413 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Thy1-204ENSMUST00000214627 446 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 AC139381.1-201ENSMUST00000224215 478 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 AC158983.1-201ENSMUST00000225691 221 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 AC166574.2-201ENSMUST00000226751 381 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Rab25-201ENSMUST00000008745 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 AW822252-205ENSMUST00000192662 1352 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 AC154738.6-201ENSMUST00000227225 1352 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm28451-201ENSMUST00000189311 2560 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Hdhd2-208ENSMUST00000148955 3069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Chrdl2-202ENSMUST00000107084 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Wdr27-206ENSMUST00000228330 2759 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Nrxn3-202ENSMUST00000110130 3654 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gpnmb-201ENSMUST00000031840 3701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Kng1-203ENSMUST00000089902 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Svil-210ENSMUST00000140448 7423 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm28791-201ENSMUST00000185888 1779 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm18639-201ENSMUST00000210442 1769 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Ighv14-2-201ENSMUST00000103467 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Mir467f-201ENSMUST00000116923 120 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm12792-201ENSMUST00000117669 1019 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm12864-201ENSMUST00000122207 1006 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 n-R5s43-201ENSMUST00000122739 110 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm8778-201ENSMUST00000127246 1107 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm11468-201ENSMUST00000152987 383 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm26070-201ENSMUST00000157500 137 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Zfp738-204ENSMUST00000175678 609 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm6410-201ENSMUST00000181337 1105 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm9531-202ENSMUST00000183511 775 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Ms4a3-202ENSMUST00000186023 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Ly6a-202ENSMUST00000186526 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm28677-202ENSMUST00000186904 615 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Cnih4-205ENSMUST00000193907 531 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm37904-201ENSMUST00000195591 312 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Igkv12-42-201ENSMUST00000198769 327 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm45346-201ENSMUST00000209925 1273 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 AC120386.1-201ENSMUST00000213434 736 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 AC124577.1-201ENSMUST00000214044 487 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 AC130829.2-201ENSMUST00000222931 127 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gng2-201ENSMUST00000055100 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Olfr1511-201ENSMUST00000078171 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm5407-201ENSMUST00000080694 747 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm7275-201ENSMUST00000088296 744 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Clec3a-201ENSMUST00000009018 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm4149-201ENSMUST00000099371 276 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Musk-205ENSMUST00000102893 3323 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Entpd5-201ENSMUST00000021662 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Trps1-205ENSMUST00000183997 3627 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Il1f5-202ENSMUST00000114490 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 D3Ertd751e-203ENSMUST00000108065 3452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm5442-201ENSMUST00000202121 2034 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm22198-201ENSMUST00000122659 307 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm23497-201ENSMUST00000157738 130 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm6586-201ENSMUST00000167028 643 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm8857-201ENSMUST00000170064 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 1110059E24Rik-202ENSMUST00000177577 599 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 6530403H02Rik-201ENSMUST00000182099 402 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm27150-201ENSMUST00000183441 1038 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm27228-201ENSMUST00000184500 1038 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Pdlim5-209ENSMUST00000196908 1196 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm43394-201ENSMUST00000198671 694 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms