Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm6317-201ENSMUST00000183159 1000 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm18402-201ENSMUST00000203834 586 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 AC142407.1-201ENSMUST00000214371 494 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Unc93a-201ENSMUST00000084966 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Htr1d-202ENSMUST00000117699 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 P2rx2-206ENSMUST00000200214 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Rnf11-202ENSMUST00000064167 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Ighv3-8-201ENSMUST00000103483 394 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms