Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm45275-201ENSMUST00000210057 365 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Tssk4-206ENSMUST00000228041 1217 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 AC140799.1-201ENSMUST00000228866 787 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Slc7a13-201ENSMUST00000035890 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Lkaaear1-201ENSMUST00000052416 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Mir30c-1-201ENSMUST00000083556 89 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Lpin3-203ENSMUST00000109456 3470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Olfr1219-203ENSMUST00000214442 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Nek10-203ENSMUST00000112631 3386 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm29055-201ENSMUST00000186337 1710 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm37537-201ENSMUST00000192154 1738 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Lipc-204ENSMUST00000216798 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm43910-201ENSMUST00000204561 3241 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gria4-201ENSMUST00000027020 5441 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm45204-201ENSMUST00000206297 1354 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 AC155941.2-201ENSMUST00000218795 1861 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Nnt-206ENSMUST00000223268 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Robo2-201ENSMUST00000116586 4764 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Dhrs7b-202ENSMUST00000108718 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 CT009518.1-201ENSMUST00000224886 1571 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Itih5l-ps-202ENSMUST00000148862 808 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm26040-201ENSMUST00000158147 161 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm5313-201ENSMUST00000182893 987 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 AC113107.1-201ENSMUST00000218358 396 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 AC129975.2-201ENSMUST00000223705 775 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Hspb3-201ENSMUST00000054650 781 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Myo1g-201ENSMUST00000003459 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Gm10824-201ENSMUST00000220000 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Foxn3-202ENSMUST00000085108 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Olfr444-202ENSMUST00000204092 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Fas-201ENSMUST00000025691 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Luzp1-207ENSMUST00000170102 7526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 Slc26a8-201ENSMUST00000114764 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtbrP50284 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Zfp949-203ENSMUST00000161458 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Rab27a-203ENSMUST00000184146 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Prokr2-202ENSMUST00000110156 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Cops2-201ENSMUST00000028635 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LtbrP50284 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Cald1-202ENSMUST00000079391 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Gm33023-202ENSMUST00000212450 1571 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbrP50284 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Gm7942-201ENSMUST00000163216 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Drosha-207ENSMUST00000169061 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbrP50284 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Immt-201ENSMUST00000064062 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Rnasel-201ENSMUST00000086209 2938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Cdk20-201ENSMUST00000021939 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Plekho2-201ENSMUST00000068944 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtbrP50284 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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