Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Hmgn2-202ENSMUST00000102552 676 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm14528-201ENSMUST00000120615 231 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm8529-201ENSMUST00000183298 745 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm17979-201ENSMUST00000196646 611 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm10155-201ENSMUST00000084598 483 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm28250-201ENSMUST00000187025 2168 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm37157-201ENSMUST00000192120 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm37112-201ENSMUST00000194389 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm35725-201ENSMUST00000221862 2800 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 1700001L19Rik-201ENSMUST00000022007 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm11548-201ENSMUST00000140203 2199 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Prpf40a-208ENSMUST00000210789 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm10591-201ENSMUST00000178168 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Ccl21b-202ENSMUST00000178864 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm12117-201ENSMUST00000183831 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 AC162176.1-201ENSMUST00000216490 618 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Paqr7-202ENSMUST00000095074 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Pln-202ENSMUST00000163319 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Elp3-201ENSMUST00000022609 2851 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Utp14a-201ENSMUST00000080713 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Eftud2-201ENSMUST00000021306 3324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Slfn5-202ENSMUST00000108157 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Tmem174-201ENSMUST00000050389 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Zscan26-202ENSMUST00000110485 4366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gucy2c-201ENSMUST00000032338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm13108-201ENSMUST00000122287 1455 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Olfr1564-203ENSMUST00000213642 5271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Olfr1564-205ENSMUST00000215450 5281 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Zfp148-201ENSMUST00000089677 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm18637-201ENSMUST00000217665 1900 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Icosl-201ENSMUST00000105393 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Gm16497-201ENSMUST00000222024 2842 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Foxp3-203ENSMUST00000115739 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Cd36-206ENSMUST00000197890 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Prpf8Q99PV0 Olfr639-201ENSMUST00000106862 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 Tnfaip8-213ENSMUST00000180305 369 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 Ppp1r2-ps7-202ENSMUST00000185057 763 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 Gm38051-201ENSMUST00000193740 433 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 Gm4863-201ENSMUST00000196907 1381 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Prpf8Q99PV0 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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