Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Gm7115-201ENSMUST00000193706 832 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Ppp1r12a-201ENSMUST00000070663 3403 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Itgbl1-201ENSMUST00000049681 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Rars-201ENSMUST00000018992 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 L1cam-203ENSMUST00000114430 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Tbc1d14-221ENSMUST00000171385 3884 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Drp2-204ENSMUST00000113228 3141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Brinp3-205ENSMUST00000166814 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Ptchd1-201ENSMUST00000038665 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Prox2-202ENSMUST00000177289 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Slc1a1-201ENSMUST00000025875 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PtprtQ99M80 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm15925-201ENSMUST00000120641 1881 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Atf7-203ENSMUST00000169033 2165 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Arpp19-209ENSMUST00000169492 3963 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Ap1s3-203ENSMUST00000162342 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Elovl4-201ENSMUST00000034796 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Scrn3-201ENSMUST00000090811 3309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Clip1-201ENSMUST00000031382 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 C79130-201ENSMUST00000199610 4296 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm4907-202ENSMUST00000163718 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm6063-201ENSMUST00000206958 485 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm3147-202ENSMUST00000201071 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 A430089I19Rik-201ENSMUST00000097479 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Cenpi-202ENSMUST00000101251 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm2233-201ENSMUST00000222566 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Txndc16-209ENSMUST00000153383 3691 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Arpp19-205ENSMUST00000168166 3944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm35048-201ENSMUST00000192105 2802 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm45694-201ENSMUST00000212022 3251 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Slc4a2-203ENSMUST00000115049 3924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 1700024J04Rik-201ENSMUST00000093146 1821 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Pabpc6-201ENSMUST00000057190 3208 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Pde6h-202ENSMUST00000137768 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm45289-201ENSMUST00000211048 2577 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Csf3r-202ENSMUST00000106162 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms