Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm884-202ENSMUST00000167262 4576 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Ezh1-202ENSMUST00000107284 4207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Arsj-201ENSMUST00000093976 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Tcf23-201ENSMUST00000006818 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Rpgr-205ENSMUST00000115533 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 C330007P06Rik-202ENSMUST00000115248 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Fmr1-202ENSMUST00000114653 4058 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Sncaip-202ENSMUST00000115410 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Ripor2-203ENSMUST00000091694 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm44684-201ENSMUST00000205388 2926 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm43890-201ENSMUST00000203437 2799 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Ghitm-202ENSMUST00000165649 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Elovl4-201ENSMUST00000034796 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Cass4-203ENSMUST00000109136 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Zfp408-202ENSMUST00000111333 3740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm38251-201ENSMUST00000192968 2575 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Naa11-201ENSMUST00000060265 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Mapk14-203ENSMUST00000114752 3148 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Cyp4a30-ps-201ENSMUST00000120813 1020 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 9330179D12Rik-202ENSMUST00000180811 1001 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms