Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm5721-201ENSMUST00000119845 1696 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Fsip1-202ENSMUST00000028821 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Rpl23a-ps3-201ENSMUST00000104925 468 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Defb20-201ENSMUST00000109836 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Ccdc141-203ENSMUST00000111833 631 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Parp11-204ENSMUST00000112195 733 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm12142-201ENSMUST00000117114 485 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm14099-201ENSMUST00000117769 605 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm12192-201ENSMUST00000120146 487 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm13360-201ENSMUST00000121607 799 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm12120-201ENSMUST00000125068 592 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm25306-201ENSMUST00000175288 117 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Mir6354-201ENSMUST00000184979 116 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm37282-201ENSMUST00000191987 164 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm37665-201ENSMUST00000192353 149 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm37787-201ENSMUST00000192524 585 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm8407-201ENSMUST00000192719 427 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm36996-201ENSMUST00000194466 250 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm43835-201ENSMUST00000195932 149 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm19148-201ENSMUST00000197045 429 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm43535-201ENSMUST00000197846 164 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm44379-201ENSMUST00000204501 164 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm44268-201ENSMUST00000204814 164 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm44778-201ENSMUST00000206447 668 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm44721-201ENSMUST00000206978 472 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm45866-201ENSMUST00000212425 326 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 C230072F16Rik-201ENSMUST00000219184 1253 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 AC153500.1-201ENSMUST00000219794 625 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 AC122533.2-201ENSMUST00000223772 545 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 AC192333.4-201ENSMUST00000224269 981 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 CT025630.3-201ENSMUST00000228798 835 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 AC118250.2-201ENSMUST00000228890 416 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Mkl2-202ENSMUST00000056715 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Svs3b-201ENSMUST00000063132 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm22830-201ENSMUST00000083772 130 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm10335-201ENSMUST00000096020 468 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm10132-201ENSMUST00000099431 468 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Rorc-202ENSMUST00000197040 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Spef2-205ENSMUST00000162780 1639 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 4933402E13Rik-201ENSMUST00000051414 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm28791-201ENSMUST00000185888 1779 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm9866-206ENSMUST00000222838 1580 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Ssr3-202ENSMUST00000119896 1469 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm37168-201ENSMUST00000192965 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Cphx2-201ENSMUST00000168149 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Cphx3-202ENSMUST00000184577 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm15580-201ENSMUST00000121587 556 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TtrP07309 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms