Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Spc25-209ENSMUST00000167875 1194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm3364-201ENSMUST00000196016 1217 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Cd1d2-201ENSMUST00000041920 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Riok3Q9DBU3 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 4930578I07Rik-201ENSMUST00000193416 1372 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Ighv2-4-201ENSMUST00000103447 350 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm12180-201ENSMUST00000120905 661 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Riok3Q9DBU3 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms