Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm4120-201ENSMUST00000220456 578 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 AC164879.1-201ENSMUST00000227904 1021 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Ano7-202ENSMUST00000186641 3984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Mgat4e-201ENSMUST00000052911 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gimd1-204ENSMUST00000212804 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Spata17-205ENSMUST00000183819 1552 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm14668-201ENSMUST00000118588 1724 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Nt5c1b-202ENSMUST00000118657 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm5315-201ENSMUST00000204430 1897 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm29671-201ENSMUST00000189438 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Kprp-201ENSMUST00000072363 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 D630033O11Rik-205ENSMUST00000210802 2761 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm9246-201ENSMUST00000117587 3490 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Ttc30a1-201ENSMUST00000099994 3721 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Dpysl2-201ENSMUST00000022629 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Ctbp2-214ENSMUST00000169570 3604 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Tmem63c-201ENSMUST00000110187 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Rad54l-201ENSMUST00000102704 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 A830010M20Rik-201ENSMUST00000060553 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm8159-202ENSMUST00000170546 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gsdma2-202ENSMUST00000093938 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Myt1l-205ENSMUST00000218583 4522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Cd59b-203ENSMUST00000111131 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Mageb7-ps-201ENSMUST00000118274 1041 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm8087-201ENSMUST00000119091 567 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm20319-201ENSMUST00000172522 771 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm25301-201ENSMUST00000175285 113 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm26726-201ENSMUST00000181889 395 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm17800-201ENSMUST00000182466 971 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Avpr1b-202ENSMUST00000190410 623 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm37623-201ENSMUST00000193691 803 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 AC155269.1-201ENSMUST00000220843 769 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 AC159312.1-201ENSMUST00000221508 856 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Tcl1b3-201ENSMUST00000090990 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clcn1Q64347 Tmem19-209ENSMUST00000219890 2949 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 C2cd5-202ENSMUST00000111758 4062 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 4932438H23Rik-202ENSMUST00000114076 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gpbp1-201ENSMUST00000047627 3694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Supt20-211ENSMUST00000200441 2154 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gucy2d-201ENSMUST00000098274 3537 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Uroc1-202ENSMUST00000164761 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 BC051077-201ENSMUST00000181440 2044 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Brpf1-201ENSMUST00000113117 4540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Ces3a-202ENSMUST00000093223 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Esrrb-204ENSMUST00000116402 4300 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Cntn4-205ENSMUST00000113261 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm5431-201ENSMUST00000109209 1701 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms