Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Zfp57-212ENSMUST00000174672 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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TtrP07309 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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TtrP07309 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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TtrP07309 Eif4a2-202ENSMUST00000077605 2708 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TtrP07309 4930503E24Rik-201ENSMUST00000219167 1333 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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TtrP07309 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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TtrP07309 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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TtrP07309 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TtrP07309 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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TtrP07309 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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