Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

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Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Pex5l-208ENSMUST00000192093 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gja1-206ENSMUST00000220069 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Ank3-219ENSMUST00000182437 3113 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Osmr-204ENSMUST00000176826 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r64-201ENSMUST00000078475 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm12258-201ENSMUST00000093768 2524 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Kif3c-204ENSMUST00000219895 2962 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Prps1l1-201ENSMUST00000134550 1676 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Syne1-202ENSMUST00000095899 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Cblb-206ENSMUST00000227879 3866 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Diexf-201ENSMUST00000085555 5570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Mertk-201ENSMUST00000014505 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Pes1-202ENSMUST00000109985 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm13243-201ENSMUST00000117481 565 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm13240-201ENSMUST00000120042 565 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc180J3QNE4 Pes1-201ENSMUST00000020705 2911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Aoc3-202ENSMUST00000103105 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Ambn-201ENSMUST00000031226 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Adamtsl3-203ENSMUST00000173287 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc180J3QNE4 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc180J3QNE4 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Eftud2-201ENSMUST00000021306 3324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Lrrc9-203ENSMUST00000161284 3817 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc180J3QNE4 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc180J3QNE4 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc180J3QNE4 Tmcc3-202ENSMUST00000117460 3217 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Stmn2-201ENSMUST00000029002 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Sdad1-203ENSMUST00000201143 2156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Cc2d2a-201ENSMUST00000048150 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Rimbp2-202ENSMUST00000196085 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Olfr270-202ENSMUST00000172257 939 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Speer9-ps1-201ENSMUST00000203447 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Aldoart1-202ENSMUST00000179234 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gucy1b3-204ENSMUST00000193597 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Snapc4-202ENSMUST00000114115 4368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Ripor2-203ENSMUST00000091694 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc180J3QNE4 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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