Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Ambn-201ENSMUST00000031226 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Mro-206ENSMUST00000179472 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Ripor2-203ENSMUST00000091694 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Mmp19-201ENSMUST00000026411 3402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 1700034I23Rik-201ENSMUST00000099123 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Il5ra-201ENSMUST00000167925 1704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Olfr381-203ENSMUST00000214623 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Anpep-202ENSMUST00000107392 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Adra1a-201ENSMUST00000054661 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Vgll1-203ENSMUST00000114746 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm13081-201ENSMUST00000121527 5599 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 2010109I03Rik-201ENSMUST00000077004 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm21129-201ENSMUST00000185932 2560 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm29258-201ENSMUST00000186842 2564 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Klhl5-201ENSMUST00000101191 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Trps1-205ENSMUST00000183997 3627 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm37409-201ENSMUST00000195811 1626 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r37-206ENSMUST00000228791 1617 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm22760-201ENSMUST00000102277 93 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm23835-201ENSMUST00000104439 132 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm12987-201ENSMUST00000118562 489 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm12421-201ENSMUST00000119071 307 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm12780-201ENSMUST00000122458 645 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm25837-201ENSMUST00000158919 108 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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Cldn23Q9D7D7 Gm8857-201ENSMUST00000170064 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Mir5623-201ENSMUST00000176631 70 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm20914-201ENSMUST00000180372 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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Cldn23Q9D7D7 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 1700081B01Rik-202ENSMUST00000197543 648 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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Cldn23Q9D7D7 Gm34611-201ENSMUST00000223252 627 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm46342-201ENSMUST00000223411 602 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 AC125350.5-201ENSMUST00000226102 517 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Dnajc5b-201ENSMUST00000029132 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Ensa-201ENSMUST00000037983 3845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Tmem241-203ENSMUST00000092075 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm37210-201ENSMUST00000192484 2004 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Cfap65-201ENSMUST00000094844 5727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gpbp1-202ENSMUST00000091236 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Scn3b-201ENSMUST00000049941 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 4930543E12Rik-202ENSMUST00000210408 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Tmem209-203ENSMUST00000115157 2273 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Tmem245-201ENSMUST00000068792 15981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Lipc-201ENSMUST00000034731 1920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Pde1c-205ENSMUST00000166102 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Cldn23Q9D7D7 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms