Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm9399-201ENSMUST00000175771 639 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm28980-201ENSMUST00000187877 219 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm29517-201ENSMUST00000190744 351 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 4933439J24Rik-201ENSMUST00000200866 853 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Zfp180-202ENSMUST00000203854 3845 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm45475-201ENSMUST00000209381 309 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm30504-203ENSMUST00000209762 1048 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 AC152922.1-201ENSMUST00000216518 1232 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 AC131745.3-201ENSMUST00000223582 554 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Mup2-201ENSMUST00000074700 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Mup7-201ENSMUST00000079697 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 H2al1j-201ENSMUST00000091180 330 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Fgf2-202ENSMUST00000091203 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Pcdhb8-201ENSMUST00000051163 3334 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Rabl3-201ENSMUST00000023524 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 4933415A04Rik-201ENSMUST00000056256 2009 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Cd101-202ENSMUST00000167086 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Npnt-201ENSMUST00000042729 3601 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Vps8-203ENSMUST00000115397 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Adam5-202ENSMUST00000118419 2791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Ptchd1-201ENSMUST00000038665 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rps29P62274 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm2a-201ENSMUST00000000608 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Fmr1os-201ENSMUST00000181533 2743 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Wdr48-201ENSMUST00000036561 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Pramef12-201ENSMUST00000030326 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Rimklb-206ENSMUST00000204731 3039 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Golga1-201ENSMUST00000039165 4869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm10069-201ENSMUST00000144745 3694 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm5931-201ENSMUST00000121308 477 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms