Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Snora65-201ENSMUST00000083190 130 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Defa28-201ENSMUST00000098887 400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Eps15-202ENSMUST00000102729 5190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Platr22-201ENSMUST00000181274 1617 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Snhg14-206ENSMUST00000187666 2517 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Clcn3-205ENSMUST00000110302 3768 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Synpo2-207ENSMUST00000198584 9203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Klrb1b-202ENSMUST00000172887 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Wdr5b-201ENSMUST00000042203 1784 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Rtl5-201ENSMUST00000113631 4653 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Dtna-201ENSMUST00000047954 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Pde1c-205ENSMUST00000166102 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm4858-203ENSMUST00000195847 1451 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm31463-201ENSMUST00000208799 1479 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm33111-202ENSMUST00000219954 3388 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Olfr381-203ENSMUST00000214623 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Mtfr1-203ENSMUST00000119865 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Olfr353-201ENSMUST00000100149 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 2310040G07Rik-201ENSMUST00000101090 478 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Sat2-202ENSMUST00000108656 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm14860-201ENSMUST00000120277 429 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Rpl37rt-202ENSMUST00000124641 294 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm11999-201ENSMUST00000145789 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 F730035M05Rik-201ENSMUST00000145871 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm16585-201ENSMUST00000161442 610 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 4931429L15Rik-203ENSMUST00000172280 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm8877-201ENSMUST00000172657 655 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm10424-201ENSMUST00000180232 1221 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm6931-202ENSMUST00000183137 1009 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Mrgprc7-ps-201ENSMUST00000187169 952 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm5857-201ENSMUST00000198953 493 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm18118-201ENSMUST00000201064 645 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm42903-201ENSMUST00000202607 481 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm30781-201ENSMUST00000204743 216 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 1700012B07Rik-201ENSMUST00000020941 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm45295-201ENSMUST00000210393 1046 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 AC160338.2-201ENSMUST00000215508 281 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 2900045O20Rik-201ENSMUST00000218374 1292 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm6989-201ENSMUST00000218409 654 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 AC153974.1-201ENSMUST00000219012 430 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm18114-201ENSMUST00000221780 523 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 AC154849.1-201ENSMUST00000224873 960 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Lpin1-202ENSMUST00000111067 5433 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm15328-204ENSMUST00000210330 1518 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Rasgrp1-205ENSMUST00000173541 2283 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Serpini2-201ENSMUST00000039047 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Krt39-201ENSMUST00000076948 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Pappa2-202ENSMUST00000159861 9518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Dbt-201ENSMUST00000000349 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Cldn12-203ENSMUST00000115446 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 4933436H12Rik-203ENSMUST00000207818 1466 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 1700027J07Rik-203ENSMUST00000217501 1884 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Tpbpa-201ENSMUST00000021885 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Sh3bp1P55194 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 AC123665.5-201ENSMUST00000226648 1392 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gsk3b-202ENSMUST00000114750 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Olfr6-201ENSMUST00000040983 6834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Sycn-201ENSMUST00000119180 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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