Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm12275-201ENSMUST00000119805 307 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm13240-201ENSMUST00000120042 565 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Bnip1-206ENSMUST00000135824 629 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm15324-201ENSMUST00000139397 355 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm11382-201ENSMUST00000140484 179 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm7076-201ENSMUST00000152421 456 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm14532-201ENSMUST00000156115 279 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 B230216N24Rik-201ENSMUST00000159324 1140 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm16541-201ENSMUST00000160992 614 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm3654-201ENSMUST00000173038 909 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 1700025H01Rik-201ENSMUST00000187479 547 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm28723-201ENSMUST00000188640 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm28361-201ENSMUST00000188825 474 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm4208-201ENSMUST00000189802 871 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Igkv9-119-201ENSMUST00000200307 353 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm42557-201ENSMUST00000202037 582 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm44148-201ENSMUST00000203718 316 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm44451-201ENSMUST00000203767 483 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm29799-201ENSMUST00000204061 487 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ceacam1-204ENSMUST00000205308 993 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr61-204ENSMUST00000211685 1212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr860-203ENSMUST00000212353 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr925-ps1-201ENSMUST00000217295 780 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC153500.1-201ENSMUST00000219794 625 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm2721-202ENSMUST00000222652 459 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC154849.1-201ENSMUST00000224873 960 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC123867.1-201ENSMUST00000224990 816 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Mbl2-201ENSMUST00000025797 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Thyn1-201ENSMUST00000039161 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm10260-201ENSMUST00000074072 561 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Eps15-202ENSMUST00000102729 5190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm7364-201ENSMUST00000188760 1501 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Rab2b-202ENSMUST00000100631 2619 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Slco4a1-201ENSMUST00000038225 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Mei1-203ENSMUST00000188048 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ect2l-205ENSMUST00000209178 2586 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Zwint-201ENSMUST00000020081 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Tnip3-208ENSMUST00000212402 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 D3Ertd751e-203ENSMUST00000108065 3452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ankfn1-202ENSMUST00000128717 2391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Cdh26-202ENSMUST00000108912 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ccdc28a-201ENSMUST00000052648 2255 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Hnrnph2-204ENSMUST00000113202 3988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm9742-202ENSMUST00000222219 1396 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Cblb-205ENSMUST00000227756 3378 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Fgr-201ENSMUST00000030693 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr1510-202ENSMUST00000215928 1934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm2233-201ENSMUST00000222566 1916 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ptbp3-210ENSMUST00000173699 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Trbv2-201ENSMUST00000103263 560 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Pcna-ps1-201ENSMUST00000118453 738 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm15464-201ENSMUST00000118718 431 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm15355-201ENSMUST00000118929 285 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm11209-201ENSMUST00000130206 431 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 D630024D03Rik-203ENSMUST00000134944 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm12223-201ENSMUST00000135468 528 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Banf2os-202ENSMUST00000145504 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm16235-201ENSMUST00000146132 342 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm8540-201ENSMUST00000168952 732 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm6919-201ENSMUST00000180049 483 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 2210420H20Rik-201ENSMUST00000188435 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ms4a10-203ENSMUST00000191343 862 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Scgb1b9-ps-201ENSMUST00000191567 266 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ighv8-16-201ENSMUST00000199258 294 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm42605-201ENSMUST00000199565 385 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm44267-201ENSMUST00000204132 385 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm18840-201ENSMUST00000204553 506 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms