Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Ankfn1-202ENSMUST00000128717 2391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Phc3-203ENSMUST00000099163 2808 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Fanci-202ENSMUST00000118959 1301 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Fam227b-201ENSMUST00000110446 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 A530040E14Rik-201ENSMUST00000093501 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm22369-201ENSMUST00000102415 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm6880-201ENSMUST00000114125 627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm14083-201ENSMUST00000117873 620 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm13863-201ENSMUST00000118782 602 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm15363-201ENSMUST00000118897 631 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm12529-201ENSMUST00000119529 268 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Fthl17-ps1-201ENSMUST00000120058 516 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm11223-201ENSMUST00000120560 450 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm15009-201ENSMUST00000121387 322 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm14856-201ENSMUST00000121548 613 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 A930019D19Rik-201ENSMUST00000135360 958 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm12248-201ENSMUST00000137124 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm6286-201ENSMUST00000145247 762 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm15833-201ENSMUST00000161563 957 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Snca-202ENSMUST00000163779 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm24327-201ENSMUST00000175108 78 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm4823-201ENSMUST00000181990 984 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm15645-202ENSMUST00000183393 1299 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Mir6356-201ENSMUST00000183541 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm6639-201ENSMUST00000196349 429 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm42793-201ENSMUST00000199139 1252 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm4873-201ENSMUST00000199402 1203 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm42538-202ENSMUST00000199431 358 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm43442-201ENSMUST00000202865 414 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm43903-201ENSMUST00000205126 617 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm45271-201ENSMUST00000211017 919 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm45676-201ENSMUST00000211306 715 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm2981-201ENSMUST00000213947 694 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 AC164092.2-201ENSMUST00000214808 753 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 CT485606.2-201ENSMUST00000216728 401 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 9230112J17Rik-202ENSMUST00000217430 764 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm40578-202ENSMUST00000221429 920 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 AC163038.3-201ENSMUST00000223945 558 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 CT010475.1-201ENSMUST00000224753 526 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Tssk4-204ENSMUST00000226591 1243 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 CT025533.1-201ENSMUST00000227485 706 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Rnf219-204ENSMUST00000228448 1056 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 AC154528.1-201ENSMUST00000228584 527 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Fam166a-201ENSMUST00000028346 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Mir212-201ENSMUST00000083656 91 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Sec16b-203ENSMUST00000111700 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm28905-202ENSMUST00000219328 1377 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Zfp983-201ENSMUST00000039726 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Cd36-206ENSMUST00000197890 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Tprkb-201ENSMUST00000067137 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gpbp1-202ENSMUST00000091236 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm28229-201ENSMUST00000188747 2153 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm11870-201ENSMUST00000119255 1322 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Rasgrp1-203ENSMUST00000172901 1903 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms