Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm13546-202ENSMUST00000138444 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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TtrP07309 Gm32089-201ENSMUST00000221222 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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TtrP07309 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TtrP07309 Lgals9-201ENSMUST00000073001 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TtrP07309 Gm9234-201ENSMUST00000077747 492 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TtrP07309 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TtrP07309 Ccdc173-201ENSMUST00000094942 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TtrP07309 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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TtrP07309 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TtrP07309 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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