Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm26992S4R1A3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm26992S4R1A3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms