Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Top3bQ9Z321 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top3bQ9Z321 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms