Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rlbp1Q9Z275 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms