Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tulp1Q9Z273 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tulp1Q9Z273 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms