Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trip6Q9Z1Y4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip6Q9Z1Y4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms