Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1M4

Rps6kb2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rps6kb2Q9Z1M4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6kb2Q9Z1M4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms