Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek4Q9Z1J2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek4Q9Z1J2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms