Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D8

Zkscan5, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 5, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan5Q9Z1D8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zkscan5Q9Z1D8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zkscan5Q9Z1D8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms