Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf1Q9Z1B8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf1Q9Z1B8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf1Q9Z1B8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf1Q9Z1B8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf1Q9Z1B8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf1Q9Z1B8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf1Q9Z1B8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf1Q9Z1B8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf1Q9Z1B8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf1Q9Z1B8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf1Q9Z1B8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf1Q9Z1B8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf1Q9Z1B8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf1Q9Z1B8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf1Q9Z1B8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf1Q9Z1B8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf1Q9Z1B8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf1Q9Z1B8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf1Q9Z1B8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms