Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rspo1Q9Z132 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo1Q9Z132 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms