Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5Q9Z131 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp5Q9Z131 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms