Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hmg20bQ9Z104 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms