Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn13Q9Z0S4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms