Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Clip2Q9Z0H8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clip2Q9Z0H8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Clip2Q9Z0H8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Clip2Q9Z0H8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Clip2Q9Z0H8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Clip2Q9Z0H8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip2Q9Z0H8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms